El agua dulce superficial está disponible dependiendo de la estación del año y proveniente de ríos, pequeños lagos y pantanos a través de todo el departamento de Carazo. No existen ríos caudalosos ni aun en el invierno y la mayoría de los ríos están secos durante largos períodos.

Las mejores áreas para la exploración de agua subterránea la constituyen los acuíferos aluviales localizados en la parte sur del departamento a lo largo de la costa del Pacífico. Estos acuíferos están a profundidades que oscilan entre los 5 y 200 metros. Se supone que hay mayores cantidades de agua a medida que se profundizan los pozos. En otras zonas del departamento las extracciones de agua requieren de pozos de mayor profundidad, lo que implica un uso más intenso de energía para el equipo de bombeo y por ende el metro cúbico de agua extraído es mucho mas caro que en otros departamentos del país.

Entre los principales acuíferos se encuentran: El grupo Las Sierras — que consiste de rocas piroclásticas basálticas a andesitas—; el grupo volcánico de Masaya —compuesto de lavas basálticas a andesitas y de materiales piroclásticos (breccia volcánica, escoria, y ceniza)—; y el grupo volcánico Apoyo —que consiste de pomas dacitas y lavas dacíticas.

La ubicación de los pozos es generalmente una tarea difícil ya que muchos pozos producen poca agua, aunque localizados en material arenoso grueso con bajos porcentajes de barro producen mayores cantidades de agua subterránea. La perforación de pozos sobre breccia requiere de técnicas de perforación en superficie dura.

Al comenzar el 2007, ENCAL operaba 37 pozos, de los cuales 4 estaban fuera de servicio.